Natamycin digunakan sebagai pengawet dalam industri makanan.Ini umumnya digunakan dalam pengawetan berbagai produk makanan, seperti keju, daging yang diawetkan, dan makanan yang dipanggang.Natamycin efektif melawan berbagai macam jamur dan ragi, menjadikannya pilihan populer untuk mencegah pembusukan dan memperpanjang umur simpan makanan yang mudah rusak.